jQuery คือ Javascript Framework ที่รวบรวม Function ต่างๆ ที่เราใช้งานกันบ่อยๆ ไม่ว่าจะเป็น Ajax , DOM element ,Event Control , จัดการ CSS , Div ,Effect, Animations ต่างๆ ให้ใช้งานได้ง่ายขึ้นและเขียน Code ได้สั้นลงกว่าเดิมครับ และสามารถใช้งานกับ Server Side ได้หลายภาษาไม่ว่าจะเป็น PHP,JSP,Perl,ASP,.Net
MooTools ก็เป็น Javascript Framework เช่นเดียวกับ jQuery แต่มาที่หลังความสามารถคล้ายๆ กับ jQuery นิยมนำมาช่วยในการทำ Effect ต่างๆ บนหน้าเว็บครับ
จะเห็นได้ว่า jQuery และ Mootools มีการนำไปใช้ในลักษณะงานที่คล้ายๆกัน แต่จะมีความแต่งตรงที่การเรียกใช้งาน ตัวอย่างเช่น
jQuery -> $(‘test’).val();
Mootools -> $(‘test’).value;